Madrasah Ibtidaiyah Al Ikhlas memiliki dua Program kelas, di antaranya sebagai berikut:
- Kelas Reguler
- Kelas Reguler adalah program Madrasah Ibtidaiyah sebagaimana mengikuti kurikulum Nasional dan Kementerian Agama.
- Kelas Pengembangan
- Kelas Pengembangan adalah program Madrasah Ibtidaiyah selain mengikuti Kurikulum Nasional dan Kementerian Agama, ada tambahan program seperti Tahsin Al-Quran dan Tahfidz Al-Quran.